1995 年，毕国智获得香港名导演及制片泰迪罗宾的青睐，推荐他在电影《香江花月夜》中担任演员、编剧、和剪接等不同层面的工作，这也是毕国智首次跃上大银幕。除了拥有丰富的电视电影编剧经验，让毕国智更自豪的，是他在执导音乐录像带，以及将经典舞台剧《雷雨》改编成为电影的制作成就。
1998年，毕国智和首次执导电影的陈辉共同制作《无问旅程》，并入选1999年柏林影展。同年他以陈果的电影《去年烟花特别多》入围香港电影金像奖最佳原著音乐，这部片也在 1999年柏林影展入选正式竞赛项目。1999年，毕国智的电影剧本《海南鸡饭》荣获台湾新闻局最佳剧本奖。同时也入选2000年韩国釜山营销计划的赞助案。
毕国智的另一个长期合作伙伴是林华全，在林华全的电影《走火枪》中，担任副导和编剧。《走火枪》在 2002年香港国际电影节成为开幕电影，意义重大，《走火枪》片同时入围第三十九届金马奖“最佳导演”、“最佳编剧”和“最佳影片”等三项大奖。
2006年，导演《海南鸡饭》，这是毕国智第一部35厘米电影作品，他也凭此片获得2006年第25届香港电影金像奖最佳新晋导演奖。2007年，毕国智又推出电影《战·鼓》，并入围第60届瑞士洛迦诺电影节。
2010年，毕国智执导伦理类影片《囡囡》，2010年04月05日在香港朗豪坊举行首映礼，主演冼色丽、诗雅、王敏奕、曾国祥、吴浩康等悉数到齐。该片讲述了几位援交女的生活经历，题材敏感却现实，紧跟时代，未知会创出怎样的成绩。
